Sí, un profesional independiente puede declarar y/o rebajar de su renta imponible lo que paga a su Isapre en forma independiente, siempre y cuando tribute en base a gastos efectivos debidamente registrados en libros contables.
Puede obtener más información relativa a este tema en el sitio web del SII, sección Normativa y legislación, Legislación tributaria y convenios internacionales, Legislación tributaria básica, opción Ley sobre Impuesto a la Renta, especidicamente en artículo 42, N° 2.